Travail perso

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Travail perso

Message par laurent le Lun 6 Déc - 23:44

Salut tout le monde,

je propose qu'on se distribue un peu les tâches pour le "travail personnel" de bio cell,
ceux qui ont trouvé des documents intéressants, pourriez-vous les mettre à disposition de tous????
J'écris pas ça pour faire le glandeur et rien chercher par moi même mais bon si on peut ne chercher qu'un peu chacun dans notre xoin et laisser znsuite les autres en profiter, pq pas...

Enfin voilà, dites moi ce que vous en pensez...

Ciao santa

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Re: Travail perso

Message par FireHead55555 le Mar 7 Déc - 1:39

Bonne idée ^^
Mais moi je m'occuperai de ce truc pendant la session, j'ai l'impression que c'est pas énorme et que ca consiste en taper la méthode sur wikipédia et lire les 2 pages qui vont sortir pour chaque méthode xD

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Re: Travail perso

Message par Corentin le Dim 2 Jan - 15:09

Justement, concernant ce travail personnel, quelqu'un a une idée de jusqu'où il faut aller dans les détails?
Car après tout, ce qu'il nous demande n'est rien de moins que d'étudier un truc pas vu au cours, donc aucune idée s'il faut juste savoir lui ressortir "la PCR permet d'amplifier l'ADN en suivant telle et telle étape", ou s'il faut aller plus loin dans les considérations d'efficacité, de facteurs limitants, de types de PCR, etc...
Une idée?

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Re: Travail perso

Message par Hecq... le Dim 2 Jan - 15:20

Un petit mail au prof et ça devrait être réglé.

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Re: Travail perso

Message par Pretoriko le Dim 2 Jan - 16:59

Perso j'ai noté, "A quoi sert la technique, Quelles en sont les applications principales et les limitations principales"
Du coup a mon avis faut aller plus loin. Faut probablement pouvoir argumenter pourquoi ,dans une situation donnée, on utiliserait plus une technique plutot qu'une autre.

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Re: Travail perso

Message par sophie le Ven 14 Jan - 2:37

est-ce que qqun sait par hasard si le "dosage des acides nucléiques par spectrophotométrie" est appelé autrement?
(parce que c'est difficilement trouvalble dans les bouquins... Sad

sophie
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Re: Travail perso

Message par Camille le Ven 14 Jan - 23:17

Oui, moi non plus, j'ai rien trouvé sur ce sujet! bounce

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Re: Travail perso

Message par *Lili** le Dim 16 Jan - 21:01

Pour le dosage spectrophotométrique... Je pense que c'est une application de la loi de Beer-Lambert...

Et j'ai trouvé que :

L’absorption dans l’UV proche permet la quantification des protéines et acides nucléiques et fournit de l’information à propos de la conformation (ou structure tridimensionnelle) des molécules en solution.

Pas grand chose de plus malheureusement :-s

Par contre, moi j'ai du mal à trouver les limitations des techniques à étudier. Mis à part pour l'électrophorèse je ne vois pas trop. Si quelqu'un pouvait m'aider là dessus ce serait super Smile

Merci beaucoup Very Happy

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Re: Travail perso

Message par omy le Lun 17 Jan - 22:23

http://wn.com/Polyacrylamide_gel_electrophoresis
voici un link avc plusieur video expliquant electrophorese sur gel polyacrylamide

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Re: Travail perso

Message par FireHead55555 le Sam 22 Jan - 16:56

sophie a écrit:est-ce que qqun sait par hasard si le "dosage des acides nucléiques par spectrophotométrie" est appelé autrement?
(parce que c'est difficilement trouvable dans les bouquins... Sad

Oui comme a dit lili c'est Beer Lambert, avec une longueur d'onde de 260 nm, grâce a ca on peut doser.
Ensuite pour calculer la pureté on fait deux autres mesures a 280 et 320 nm et puis un petit rapport :
R = (A260-A320)/(A280-A320).
Si R est inférieur a 1,8, l'ADN est contaminé avec des protéines, si R est supérieur a 2, l'adn est contaminé par des ARN. Entre les 2, l'ADN est considéré comme pur.
Ou Ax = Ex * l * C E c'est le coef d'absorption molaire à la longueur d'onde x, l l'épaisseur de la cellule et C la concentration

Je sais plus ou j'ai trouver ca, surement sur Wiki j'ai quasi tout trouvé la dessus c'est hyper complet, ya chaque fois les utilisations, les limites de détection et même souvent les comparaisons entre certaines méthodes similaires, je vois pas pourquoi chercher plus loin Neutral

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Re: Travail perso

Message par Hecq... le Sam 22 Jan - 17:41

J'ai pas exactement trouvé pareil.

Chez moi on calcule la densité optique à 260nm pour estimer la concentration d'acide nucléique. Ensuite on calcule la densité optique à 280nm (pour estimer la concentration en protéine) et on fait un bête rapport DO260/DO280. Si c'est compris entre 1,8 et 2 la contamination est suffisamment faible pour que la concentration estimée à 260nm soit correcte.

Si une contamination au phénol est possible, il faut effectuer une manipulation à 270nm en plus.

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Re: Travail perso

Message par Charlotte le Sam 22 Jan - 18:17

Moi j'ai trouvé un lien qui se rapproche plus de ce que dit Seb ... http://www.esi.umontreal.ca/~badiaa/spectro-moleculaire-3.pdf
à la page 4.

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Re: Travail perso

Message par Hecq... le Sam 22 Jan - 18:22

Bah justement : A ta page 4 il donne le même rapport que moi, alors que le rapport de Seb fait intervenir une mesure à 320nm. Surprised

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Re: Travail perso

Message par FireHead55555 le Sam 22 Jan - 18:25

C'est équivalent parce que A320 est normalement égal à 0 car ni ADN, ARN ou protéine n'absorbe ca.

C'est pour voir si ya pas une grosse crasse dans ou sur la cellule je pense, ou un composé qui se serait mis dans la solution par erreur, si la manip est bien faites ca vaut zero.
Attention le fait que ca vaille quasi toujours zero je l'ai vraiment lu, la raison pour laquelle on fait ca c'est moi qui interprète ^^

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Re: Travail perso

Message par marfaure le Dim 23 Jan - 12:47

Histoire de clarifier les choses, moi j'ai un cours de l'an dernier (j'ai fait un bac en HE avec des cours de bio mol) qui dit qu'on fait une troisième mesure à 230 nm =D


Si A230/A260 < 1,8, ça indique la présence de contaminants co-purifiés avec l'ADN. …

hum.


Sinon, y a une petite lise de 4 inconvénients de la technique :
- large contribution des acides simple brin au signal d'absorbance,
- interférences dues aux contaminants naturellement présents dans une préparation d'ac nucl (sels, urée, éthanol, chloroforme, …)
- impossibilité de distinguer ADN d'ARN
- manque de sensibilité relatif de la méthode (c'est une estimation et pas un dosage)



Voilà Smile
M.

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