Prolongation de NFkappaB dans le noyau

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Prolongation de NFkappaB dans le noyau

Message par Marie le Ven 31 Déc - 11:41

Bon je sais que personne ne répond à mes petites questions mais je vais encore faire une tentative.

Pour situé c a la page 84 du cours, et le 15ième slides du cours 2 de HIV "Deacetylase inhibitors TSA and NaBut prolong TNFa-induced DNA-binding activity and nuclear presence of NF-kB"
Ils font un gel shift à partir d'extrait nucléaire et avec une sonde pour NFkappaB, est ce que ca ne suffit pas à prouver que NFkappaB reste plus longtemps dans le noyau? Pourquoi faire encore un western blot pour prouver que la protéine est présente, le gel shift nous le disait déjà non? Si ca c lié a la sonde c que la prot était forcément là....

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Re: Prolongation de NFkappaB dans le noyau

Message par Eric le Ven 31 Déc - 15:47

Je me trompe p-e mais: la sonde c'est les 2 sites NF-KB du promoteur de HIV-1. Donc lorsque tu incubes avec tes extraits nucléaires avec ta sonde c'est juste pour voir si il y a des facteurs qui vont se lier à tes sites ( sondes) mais tu n'a aucune information quand à la nature des facteurs. C'est pour cela qu'on fait après un Western blot avec des Ac dirigé contre NF-KB pour confirmer que c'est bien de ce facteur là qu'il s'agit.

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Re: Prolongation de NFkappaB dans le noyau

Message par Marie le Ven 31 Déc - 18:38

oki, merci

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