Calcul du rms?

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Calcul du rms?

Message par sebastien le Mar 27 Déc - 17:46

Dans la formule qu'il y a dans les slides, le i c'est la position de l'atome (Calpha par exemple)?

Si oui dans cette formule pourquoi elle a mis les i en exposant??? Suspect

Perso j'aurais mis deux indices : un pour le numéros de l'atome et l'autre pour voir si il appartient à la chaine 1 ou à la chaine 2! C'est ça qu'elle a voulu écrire? confused

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Re: Calcul du rms?

Message par EmiLie le Mar 27 Déc - 18:11

oui ! (tpeux écrire les deux (appartenance protéine, et numéro de l'atome) en indice en dessous si tu préfères)

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Re: Calcul du rms?

Message par Corentin le Ven 20 Jan - 18:49

J'ai une question, pas directement en rapport avec le rms, mais dans la même partie du cours :

quelqu'un a-t-il compris le slide 13 du chapitre 2? Avec tous les arbres enchevêtrés... Je ne vois absolument pas ce que ça veut dire.
Et le slide 14 est aussi assez obscur...

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Re: Calcul du rms?

Message par Pretoriko le Ven 20 Jan - 19:02

Pour le slide 13 d'après ce que je pense avoir compris... p-e que après avoir identifier les segments similaires entre nos 2 protéines (qui correspondent aux points gris tout en bas) on tente de combiner plusieurs de ces paires de segments tout en voulant garder un rms le plus petit possible (J'ai l'impression de répeter ce qu'il y a dans ses slides... :p). Et donc on crée des groupes de paires de segments de plus en plus gros jusqu'à prendre en compte toutes nos paires de segments.

Après concrètement je sais pas du tout comment ça se passe... On dirait que le but c'est de trouver la bonne séquence de combinaison de paires de segments pour minimiser la rms.

Slide 14 aucune idée... On dirait qu'on tente de raffiner la structure comme si on poussait sur les chaines pour qu'elles se recouvrent... fin bref...

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Re: Calcul du rms?

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