Croissance et signalisation : questions des années précédentes

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Croissance et signalisation : questions des années précédentes

Message par Olivier William le Mer 28 Déc - 1:02

questions de Caro:

- parler de la voie de signalisation TOR. Elle ne me donne pas son nom, elle introduit le sujet en me demandant si je ne connais pas une voie qui permet la croissance et qui est activée par la présence d'aliments.

-comparer le cycle de vie de cerevisiae et du champignon crassa.



Pour Monsieur Robaye,

- le NO et son récepteur.

- la désensibilisation homologue avec l'internalisation et l'expérience prouvant que la phosphorylation est nécessaire pour l'internalisation.

Il aime bien les expériences. Il a aussi demandé à d'autres personnes, comment la protéine Galpha 12 est phosphorylée par PKC (expérience in vivo et in vitro je pense).

mes questions:

MMe dubois: -comment ça se fait qu'on trouve des levures à l'état diploide dans la nature? (--> diploidisation, TOUT)
-XP d'immunoprecipitation de la chromatine

Mr Robaye: -toutes les voies de signalisation différentes permettant d'amener le signal jusqu'au noyau
- XP à propos de EPAC ac le GDP fluorescent, rap1 et l'activite GEF (commenter les courbes)

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Alors pour la posterité du premier étudiants a avoir passé cet exam.

Dés le debut ça demarre fort, pas de préparation, total impro. Dubois attaque avec le cycle cellulaire et le comment de la régulation a partir de taille. Et elle creuse le sujet. Ensuite elle enchaine avec les phéromones, expliquer la productions de alpha et la comparé avec a.

La dessus robaye enchaine sur le recepteur au pheromones alpha, GPCR (ben tient) et on a y vas sur une explication des GPCR. Et aprés seulement on passe à l'exam de Robay, une feuille avec plusieur question à lire et à répondre devant lui dont un schéma avec des blanc.
La PKA est elle membranaire, L'adenylate cylase est elle cytosolique, comment prouver que la SU alpha porte une spécificité pour son recepteur (si vous ne vous souvenez plus exactement de la manip c'est pas grave mais le principe est important. Et pour finir différence entre activation de AC et PKA.
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Dubois:
- interconversion des types conjugants: tout expliquer.
- les protéines Tor : elles servent à quoi etc.. mais je n'ai pas du expliquer toutes les différentes régulations! (heureusement! elles sont impossibles à retenir!).
Avec elle, c'est "simple": faut TOUT connaitre. si tu sais pas repondre, elle lache pas l'affaire.

Robaye:
- est-ce que pertussis toxine inhibe Galpha i? a quoi servent les outils pharmacologiques?
- expériences: phosphorylation de Galpha et pas interaction avec beta-gamma...
- phosphorylation de GPCR et phosphorylation de RTK
- un giga dessin de voies de signalisations, donc avec pleins de protéines partout --> dire ce que sont les protéines masquées.
Il est très sympa, il aide beaucoup quand on ne sait pas repondre!
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Alors M.Dubois a demanfé à moi:
-la réponse au stress osmotique: la différence entre les deux voies et les mutants fait pour connaître tous les constituants de chaque voies.
-la réponse au glucose : comment les gènes du métabolisme d'autres sucrec est-elle suprimé? (comples Snf1 et Mig1)

M.Robaye:
- quels sont les composé d'une voie de signalisition? (il demande un truc tout cons: cellules émétrices, ligand, cellule réceprtice). Et quel genre de molécule interviennent dans une voie de signalisation (protéine, glucides, lipides, ions,......)
- Un shéma où ils fous dire le noms des trucs caché.
- les deux pathologie lié à la voie de signalisation de l'insuline (diadète de tipe I et II)

Ah oui, j'oublais, M.Robaye m'a également demander ce que représentait la compartimentalisation dans les voies de signalisation, localisation subcellulaire y compris dans le cytoplasme (AKAP, proteine d'échaffaudage,..).
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bon d'abord, c'est pas vrai qu'il faut TOUT connaitre, je me suis amusée à tenter d'étudier TOUS les mécanismes dans leur moindre détail, c'est un très mauvais plan; on mélange tout et on fait pire que mieux.
Laissez tomber les détails si ça rentre pas mais visualisez bien les voies dans leur ensemble (genre les schémas sur les slides dans les grandes lignes).
Par contre, ils aiment bien savoir comment on est arrivé à telle ou telle conclusion; pas les mutants et tout mais les expériences du genre double hybride, rapporteur, gel retard...

Mes questions: les types de levures S. cerevisiae, les différents modes de croissance (juste citer), la conjugaison et ensuite la réponse au glucose. J'ai tt embrouillé, jme rappellais pas de la voie l'activation de Snf1 et ça avait l'air pas grave. (j'estime avoir 13-14 au pire)
Ensuite, c'est quoi la signalisation (cellule émettrice, signal, récepteur), les types de signaux et ça a continué comme ça sur des trucs mais limite culture générale quoi sleep.gif

Donc, j'ai perdu plein de jours à étudier des détails que j'ai oublié sur le moment même et qui m'ont empêché de réfléchir...ne faites pas cette erreur ^^
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j'ai pas géré jme suis embrouillée a mort no.gif

mais pour ce qui vous intéresse : parler de la diploïdisation, du gène HO (j'ai du tout expliquer donc je vois pas ce que aria veut dire avec "ne pas étudier les détails"). Après ca parler des voies avec AMPc. Ensuite toutes les voies qui mettent en jeu le calcium... enfin un peu de tout.

Sachez faire des liens entre les deux cours ! ayez les différentes voies bien en tête pcq il n'y a pas de préparation donc c'est du tac au tac.
Mais les profs encouragent et sont sympas
Faites mieux que moi !
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Dubois: donner la voie de signalisation liée à la réponse au phéromones
régulation par les a.a. : importance de GCN4

Robaye: les techniques utilisées pour déterminer si deux GPCR interagissent
PIP3 et son activité
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Moi j'ai eu pour Dubois la réponse au stress osmotique, tout.
Puis pour la 2ème partie j'ai eu les protéines G: la relation entre la voie de l'AMPc et la voie du calcium et après l'apoptose.

C'est vrai qu'ils aident: j'avais oublié quasi tous les noms de ces foutues protéines à la c** pour la première partie. Robay m'a sauvé la vie en disant qu'il n'avait jamais rien compris aux noms que donnent les gens qui travaillent sur la levure et Dubois à dit quelle était d'accord. Je retire tout ce que j'ai toujours dit sur les cigarios lol. venere2.gif
Et comme je savais discuter des mutants ça a été.
Puis j'ai eu un big TROU avec Robay, il a dit que ça arrivait à tout le monde et il m'a mis sur la voie.
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Alors moi c'était l'interconversion du type conjugant, la meiose, Robay il m'a un peu balladé. Soyez précis dans votre vocabulaire.
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Hello,

Pour ma part:

- l'interconversion de type conjuguant. Quelles sont les conditions requises pour que cela se produise? Alors je vous avoue que je confondais tout et elle m'a mise sur la piste.
- Les deux voies possibles de développement pseudo-hyphal -> AMPc dépendante et l'autre avec STE11 ect.

Ensuite bernard Robaye a fait un lien avec son cours: A quoi fait penser la protéine Bcy -> à PKA.

- Expliquer l'expérience avec P2Y4 et P2Y6 ( pour rappel c'était la phosphorylation qui permettait l'internalisation). Après j'ai eu l'arestine et tout expliquer.
- Donnez deux voies bien différentes qui conduisent aux MAP kinases.

Voilà, ça a l'air compliqué comme ça mais ils aident beaucoup et l'essentiel est d'avoir compris les principes généraux. J'ai pas toujours su donner tous les mécanismes mais avec leur aide je retombais sur mes pattes et au final ils ont été super contents.
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- les phéromones => Tout
- Régulation des acides aminés
- GPCR
- voie de la PI3K
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Re: Croissance et signalisation : questions des années précédentes

Message par Antonin le Mer 28 Déc - 10:39

Merci St tob!

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Re: Croissance et signalisation : questions des années précédentes

Message par Olivier William le Jeu 12 Jan - 16:51

Dubois :
- Structure d'une PKA, amont de la PKA, aval de la PKA, donner les différentes voies où la PKA intervient (Nutriments, Pseudohyphe, Meiose).
- Voie de la réponse au stress osmotique, dire à quoi elle sert, donner les 2 récepteurs, et surtout l'expérience avec les mutants qui ont permit de trouver les constituants de la voie.

Elle demande des ptits détails par-ci par là : la famille de kinase de la voie du stress osmotique, différence entre sous unité et un domaine,...

Robaye :
- Voie complète de la contraction et de la relaxation des muscles (récepteur au NO et tout le bazar), les récepteurs selon l'endroit où ils se trouvent provoquent une réponse différente (ca aboutit à une phospho ou a une déphospho d'une myosine si je me souviens bien)
- Récepteur intracellulaire au glucocorticoide (récepteur de type I), expérience qui permet de dire que le récepteur une fois activé passe du cytoplasme au noyau (GFP associé au récepteur) et un contrôle qui permet de dire que c'est pas tout simplement le GFP qui est envoyé au noyau (GFP pas associée plus stimulus -> tout reste dans le cytoplasme)

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Re: Croissance et signalisation : questions des années précédentes

Message par Corentin le Mar 8 Jan - 19:39

Pour la postérité :

Dubois :
- Expliquer la voie de signalisation régulant la croissance --> TOR
Un peu tout expliquer, l'inhibition par la rapamycine, les complexes Torc1, Torc2, les fonctions cellulaires favorisées et inhibées par Tor...
Le mode d'action principal (séquestration de trucs dans le cytoplasme, ou le noyau, etc.), avec exemples, le mode d'action via les phosphatases aussi (via Tap42 qui les inactive...) avec exemples aussi
- Les mutants de la voie de reproduction asexuée chez Aspergillus nidulans (formation du conidiophore). De nouveau parler de tout : de la formation du conidiophore et des conidies en général, des mutants principaux brlA, abaA et wetA, puis de tous les autres mutants, leur rôle, etc. Puis aussi FadA, comment ça fonctionne, où se trouve la mutation dominante? (site GTPasique de la sous unité alpha des protéines G). Quelle voie FadA enclenche? (PKA). FlbA? etc.

Robaye :
- Voies médiées par le Calcium. Un peu de tout, mais rien très en profondeur. Donc parler de comment le calcium augmente dans le cytoplasme (transport depuis RE et extracell), et ce transport est provoqué par quoi? --> récepteurs à l'IP3 (donc parler un peu des PLC), à la ryanodine, à l'AMPc ou GMPc (les CNGC), ou les canaux voltage-dépendants... Puis quelle est l'action du calcium? --> protéines régulatrices (ex. calmodulin) ou effectrices (ex. PKC).
- Expérience pour montrer que les TKR peuvent faire de la transphosphorylation pour s'activer (exp avec les PDGFR alpha ou beta, etc.)

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Re: Croissance et signalisation : questions des années précédentes

Message par Corentin* le Mar 7 Jan - 19:10

Bon, je lance le bal des questions 2013-2014:

1ère question: Récepteur au NO et vasodilatation >< vasoconstriction

***Comment se fait-il qu'avec un seul agoniste, on puisse avoir 2 réponses différentes?

Donc, ça faut expliquer les 2 mécanismes (Cellule endothéliale --> Cellule musculaire et vice versa).

***Quelle est l'action du NO sur la GC (Guanylate cyclase, qui fait du GMPc à partir de GTP)?

La GC comprend un groupe Hème et le NO chélate l'atome de fer, ce qui libère une Histidine stratégique.

2e question: Les GPCRs et la dimérisation

***Les GPCRs fonctionnent-ils sous forme de dimères?
Oui, du moins, beaucoup d'indices semblent le montrer.

***Quelles sont les 3 types d'expériences qui permettent de mettre en évidence l'interaction de 2 GPCRs?
BRET
Immuno-précipitation
Trans-complémentation
---> chacune à expliquer, bien sûr

3e question: p53
**Qu'est-ce que p53?
**Dans quelles condition est-il activé? (stress cellulaire => MNR==> ATM qui active CHK2 (qui phosphoryle p53) et phosphoryle p53 et Mdm2,....et patati et patata)
**Quels gènes régule-t-il positivement (des Bh3 only, un chélateur d'IGF, p21 (un CKI, inhibiteur des cdk-cycline)...) et négativement (Bcl2 = antiapotique de la famille Bcl2)?
--> avec à chaque fois la fonction de chacune des protéines

Voilà!

PS: 1) Il est très sympa. Vous présentez au tableau (pour ceux qui doivent se préparer au douloureux contact de la craie).
2) Il prend de l'avance donc arrivez bien 40 min à l'avance :p

Corentin*
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Re: Croissance et signalisation : questions des années précédentes

Message par ben le Mer 8 Jan - 11:48

Une expérience Avec la toxine cholérique ==> donc activation d'alpha-s. L'expérience aboutissait à la synthèse de protéine, donc surement activation de PKA. Donc faire le schéma complet.
Ensuite expliquez comment cette voie pourrait être régulée négativement, à tous les niveaux. (en gros tout le chapitre 3)
Ensuite, expliquer l'expérience qui prouve la transphosphorylation des RTK.
Enfin : agent promoteur et initiateur : définir, donner un exemple, et une expérience qui prouve cela.


Ne vous en faites pas pour cet examen!


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Re: Croissance et signalisation : questions des années précédentes

Message par Berengere le Jeu 9 Jan - 20:07

Pour les futurs:
- la voie canonique du TGFbeta (question subsidiaire: une autre voie du TGF beta --> MAP kinases, il les aime bien! )
- modèle du triple passage membranaire: quelles expériences on ferait pour le démontrer... (donc de GPCR ---> MAP kinases via TKR). Autres façon pour GPRC d'induire les MAPK? (EPAC et Arrestine)
- pourquoi les cellules tumorale stimule l'angiogénèse? De là: effet Warburg etc...

Il est gentil, mais pointilleux sur le voc. Et il attend clairement des liens entre toutes les parties du cours... bref, peace, mais pas tant que ça à étudier :/

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