Rôle des introns dans le NMD des eu. sup.

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Rôle des introns dans le NMD des eu. sup.

Message par Cyril le Mar 17 Jan - 15:27

Salut à tous !

Petite question quant au rôle des introns dans le Non-Sense Mediated Decay chez les eucaryotes supérieurs.

On parle du fait qu'aux alentours de la jonction exon-exon il a liaison du complexe post-épissage qui fait 50 nt de rayon en gros et donc ci un PTC est présent à < de 50 nt de la jonction il ne sera pas détecté... Ca ok. Mais pourquoi cette non-détection ne s'applique qu'à la dernière jonction exon-exon et pas dans les autres, où on voit que même si le PTC est à moins de 50 nt de la jonction l'ARN sera dégradé...

Merci d'avance Very Happy

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Re: Rôle des introns dans le NMD des eu. sup.

Message par Pretoriko le Mar 17 Jan - 17:25

Je pluissoie, ça m'intéresse aussi...

Par contre j'ai une autre question dans le même chapitre :p

J'pense qu'elle en avait parlé mais j'avais pas suivi. Sur la slide 27, quand elle compare le mécanisme entre mammifères et invertébrés. Ok les mammifères présentent le complexe de jonction, mais pour les invertébrés? Ils n'en présentent pas, mais du coup ils présentent tous une séquence DSP (associé à hrp1) comme pour la levure? pcq c'est pas précisé sur le dessin si il y a une DSE...
Si non comment c'est régulé chez eux? Question
mouarf ça commence à me saouler tout ça Neutral

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Re: Rôle des introns dans le NMD des eu. sup.

Message par Cyril le Mar 17 Jan - 17:52

Pour les invertébrés je crois qu'il y a juste un scanning depuis le PTC jusqu'à la polyA sans séquence DSE entre... L'idée du système est de regarder la distance entre le codon stop repéré et la queue polyA. Si la distance est plus longue que la distance moyenne entre le vrai codon stop et la queue polyA, ça veut dire que c un PTC ==> enclenchement du NMD.

Par contre le système n'est pas plus détaillé que ça il faut juste savoir je pense.

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Re: Rôle des introns dans le NMD des eu. sup.

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