Système Gateway de Vanhamme
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Système Gateway de Vanhamme
Koukou, dites, est-ce que quelqu'un comprend le système Gateway, parce que je bloque dessus et ça m'énerve.
Merci, courage à tous, plus que 16h
Merci, courage à tous, plus que 16h
fredzouille- Mitochondrie
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Nombre de messages : 40
Année d'étude : MA2
Section : Bioingénieur
Date d'inscription : 16/02/2009
Re: Système Gateway de Vanhamme
Dapres ce ke jai compris:
C'est un Système alternatif aux enzymes de restriction : éviter l’utilisation d’enzymes de restriction et de ligase.
Cette méthode permet la recombinaison directionnelle d’un fragment ADN produit par PCR dans un plasmide.
Le transfert de fragment d’ADN entre différents vecteurs est ainsi grandement facilité.
C'est un Système alternatif aux enzymes de restriction : éviter l’utilisation d’enzymes de restriction et de ligase.
Cette méthode permet la recombinaison directionnelle d’un fragment ADN produit par PCR dans un plasmide.
Le transfert de fragment d’ADN entre différents vecteurs est ainsi grandement facilité.
Dernière édition par hicham le Lun 18 Jan - 0:34, édité 1 fois
hicham- Mitochondrie
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Nombre de messages : 31
Année d'étude : MA2
Section : Bioingénieur
Date d'inscription : 05/11/2008
Re: Système Gateway de Vanhamme
Oui, ok, merci.
Et les schémas, tu les comprends? Pcq il est passé hyper vite dessus et j'ai rien compris
Et les schémas, tu les comprends? Pcq il est passé hyper vite dessus et j'ai rien compris
fredzouille- Mitochondrie
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Nombre de messages : 40
Année d'étude : MA2
Section : Bioingénieur
Date d'inscription : 16/02/2009
Re: Système Gateway de Vanhamme
non pas vraiment
je crois que les schémas montrent les sites de recombinaisons homologues P, B, R,L etc et montrent le fait qu'une séquence d'ADN peut être passée vite fait d'un vecteur á l'autre..
je crois que les schémas montrent les sites de recombinaisons homologues P, B, R,L etc et montrent le fait qu'une séquence d'ADN peut être passée vite fait d'un vecteur á l'autre..
hicham- Mitochondrie
-
Nombre de messages : 31
Année d'étude : MA2
Section : Bioingénieur
Date d'inscription : 05/11/2008
Re: Système Gateway de Vanhamme
Moi je comprends pas trop son slide, mais voila ce que j'ai noté:
Plutot que d'utiliser des enzymes de restriction, on utilise plutot des SI (séquences d'insertion) reconnue par des transposases (principe des transposons)
Donc commercialement, ça revient à vendre des plasmides "vierges", contenant tout ce qu'il faut (gène de sélection, gène rapporteur, ori ...) mais à la place d'un MCS, on a plutôt une petite portion bordée de 2 SI.
On vend également des amorces pour notre gène d'interêt, bordée de SI. Donc en gros avec ces amorces on fait une PCR pour avoir plein d'exemplaires de notre gène d'interêt bordé des SI.
En mélangeant nos exemplaires (bordés de SI) avec les plasmides fournis, et en ajoutant un peu de transposase (enzyme transposition), ben nos gènes d'interêt vont gentillement s'insérer entre les deux SI des plasmides.
Après on insère le plasmide dans l'organisme producteur/cloneur.
Mais comment savoir quelles bactéries ont intégré les plasmides qui avaient eux même intégré le gène d'interêt ??
Sélection via systeme poison/antidote!
Sur les plasmides a la base ya un gène qui code pour une toxine. Sur la séquence avec le gène d'interet, ya la séquence qui code pour l'antidote.
Bref, seules les bactéries qui auront intégré le plasmide ayant intégré la séquence par transposition survivront :
- à l'antibiotique du milieu de culture (gène resistance sur plasmide)
- à la toxine qu'elle synthétise elles-mêmes grace a l'antidote qu'elles synthétise aussi si elles ont le bon plasmide.
En plus ça permet de conserver les bactéries qui auront encore le plasmide après division. Si après division elles ont perdu le plasmide, ben l'antidote se dégradant beaucoup plus vite que le poison, elles meurent.
Voila voila c'est un peu long mais j'ai fait au mieux =)
Plutot que d'utiliser des enzymes de restriction, on utilise plutot des SI (séquences d'insertion) reconnue par des transposases (principe des transposons)
Donc commercialement, ça revient à vendre des plasmides "vierges", contenant tout ce qu'il faut (gène de sélection, gène rapporteur, ori ...) mais à la place d'un MCS, on a plutôt une petite portion bordée de 2 SI.
On vend également des amorces pour notre gène d'interêt, bordée de SI. Donc en gros avec ces amorces on fait une PCR pour avoir plein d'exemplaires de notre gène d'interêt bordé des SI.
En mélangeant nos exemplaires (bordés de SI) avec les plasmides fournis, et en ajoutant un peu de transposase (enzyme transposition), ben nos gènes d'interêt vont gentillement s'insérer entre les deux SI des plasmides.
Après on insère le plasmide dans l'organisme producteur/cloneur.
Mais comment savoir quelles bactéries ont intégré les plasmides qui avaient eux même intégré le gène d'interêt ??
Sélection via systeme poison/antidote!
Sur les plasmides a la base ya un gène qui code pour une toxine. Sur la séquence avec le gène d'interet, ya la séquence qui code pour l'antidote.
Bref, seules les bactéries qui auront intégré le plasmide ayant intégré la séquence par transposition survivront :
- à l'antibiotique du milieu de culture (gène resistance sur plasmide)
- à la toxine qu'elle synthétise elles-mêmes grace a l'antidote qu'elles synthétise aussi si elles ont le bon plasmide.
En plus ça permet de conserver les bactéries qui auront encore le plasmide après division. Si après division elles ont perdu le plasmide, ben l'antidote se dégradant beaucoup plus vite que le poison, elles meurent.
Voila voila c'est un peu long mais j'ai fait au mieux =)
Thomas- A.D.N.
- Nombre de messages : 380
Option : Chimie et bioindustries
Date d'inscription : 27/08/2008
Re: Système Gateway de Vanhamme
Cool, merci à vous deux, j'ai compris et ça confirme les bribes que j'avais écrites. C'est cool. Bon, par contre, j'ai été vérifier sur internet et là, pour le système Gateway, ils parlent à aucun moment d'un système avec transposases, mais bon, j'ai noté ça aussi. Autant étudier ce que le prof dis.
fredzouille- Mitochondrie
-
Nombre de messages : 40
Année d'étude : MA2
Section : Bioingénieur
Date d'inscription : 16/02/2009
Re: Système Gateway de Vanhamme
clair ça me semble bizarre aussi...
sinon le seul lien entre son slide et mes notes c'est que ccBD c'est une des composants du systeme toxine/antidote -_-
sinon le seul lien entre son slide et mes notes c'est que ccBD c'est une des composants du systeme toxine/antidote -_-
Thomas- A.D.N.
- Nombre de messages : 380
Option : Chimie et bioindustries
Date d'inscription : 27/08/2008
Re: Système Gateway de Vanhamme
j'ai pas l'empression qu'il parle de ça dans les slides de l'année passée, ça me faitr un peu flipper.
mais en tout cas merci thom, ton ptit résumé est super
mais en tout cas merci thom, ton ptit résumé est super
fletteman- Neurotransmetteur
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Nombre de messages : 216
Année d'étude : MA1
Section : Bioingénieur
Date d'inscription : 30/11/2008
Re: Système Gateway de Vanhamme
moi j'ai noté ca comme deux systèmes alternatifs différents aux enzymes de restricction
on utilise soit le syst gateway soit transposase, mais j'ai pas compris gateway mais en tout cas c'est rien à voir avec tsposase...
on utilise soit le syst gateway soit transposase, mais j'ai pas compris gateway mais en tout cas c'est rien à voir avec tsposase...
Odile- Dopamine
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Nombre de messages : 139
Année d'étude : MA2
Section : Bioingénieur
Date d'inscription : 01/09/2008
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