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Ramachandran

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Message par Lise Mar 28 Déc - 22:40

est ce que vous pensez que c'est important?genre le truc avec tous ses graphes?
j'arrive même pas a retenir le nom XD

merchiiii
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Message par Arnaud Mar 28 Déc - 22:47

Oui il en a parlé à la séance de révisions. Il faut pouvoir expliquer le diagramme (comment il fonctionne), de savoir où se trouvent phi et psi sur celui-ci , où se trouvent les différentes structures (par ex. tu dois pouvoir replacer une hélice alpha ou un bete truc comme ca)...
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Message par Lise Mar 28 Déc - 23:04

rolala ^^ merci qd mm

et les 2 différentes couleurs correspondent à quoi? et les sortes de courbes de niveau qui commencent à 2??

merciiiii
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Message par Arnaud Mer 29 Déc - 0:05

Le diagramme sur lequel il avait insisté pendant la séance de révisions était le premier (jaune et orange),plus simple, dans lequel les zones oranges sont les conditions optimales ("un vrai feuillet beta" par ex) et les zones jaunes sont celles qui correspondent a des conformations "hors limites"(des distance de VdW calculées entre atomes ).

Pour le deuxième (avec les courbes), j'ai trouve des explications sur les courbes:
elles correspondent à n qui désigne simplement le nombre d'unités par tour d'hélice (+ pour droite, - pour gauche)
ex: l'hélice alpha gauche a par exemple entre "-3" et "-4" unités par tour
Pour les couleurs, je ne sais pas...

Mais je ne sais pas si le prof avait vraiment détaillé celui-là au cours...Je pense que comprendre le concept général est déjà pas mal Very Happy
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Message par Lise Mer 29 Déc - 0:11

oki dok thx a lot! Very Happy
mais tu vx dire quoi par conformation "hors limites"?
conditions pas optimale? et il avait rien dit de spécial au cours(sauf si je dormais juste à ce moment...)
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Message par Arnaud Mer 29 Déc - 0:49

Ben dans mon livre, ils disent que le diagramme est au départ calculé sur base des distances de vdw entre atomes, possibles pour chaque combinaison d'angles (du a l'encombrement etc), et que les zones élargies sont celles ou on a trouve des conformations possibles sur certaines proteines mais dont les distances entre atomes ne correspondent pas aux distances de vdw (hors limite).

Plus simplement il a juste dit que c'était des cas ou les structures sont moins parfaites...
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