Chapitre 4 - Exercice sur équilibre mutation-dérive (page 35)

Comme sous question, ils demandent quel sera l'impact de l'He (het attendue) sachant que les microsatellites tendent à muter par addition ou délétion d'un motif répeté.

J'aurais répondu que vu que nous sommes dans un modèle de sites infini d'allèles que 2 mutations ne peuvent se produire sur le même allèles et que le même allèle ne peut apparaître 2x, donc que He augmente..

Mais ils disent le contraire... Y'a quoi d faux dans mon raisonnement?

Attention, c'est modèle à nombre infini d'allèle ^^

Mais j'avoue que j'aurais tendance à dire comme toi, pour moi en nombre infini d'allèles, il y'a moins de mutations au total (Ne.mu plus petit) puis qu'on ne détecte pas les mutations convergentes. Or dans H=théta/1+théta, si Ne.mu augmente (modèle pas par pas ou en 2 phases, peu importe), H va augmenter... Mais bon il est bien indiqué qu'on ne peut utiliser cette formule que pour le modèle à nombre inifini d'allèles, ce qui explique probablement pourquoi mon raisonnement est faux.

Si je devais vraiment expliquer pourquoi He diminue en modèle pas par pas par rapport au modèle à nombre infini d'allèles, je dirais que étant donné qu'il peut y avoir convergence, au final, il y a moins de mutations qui donnent de nouveaux allèles (avant toutes les mutations donnent de nouveaux allèles, ici elles peuvent soit donner de nouveaux allèles, soit muter en un allèle qui existait déjà) donc on a moins de diversité génétique, donc He diminue (He=la sommes des 2pq, donc si y'a moins d'allèles différents, il y a moins de termes à cette somme...). Mais bon c'est un peu au pif, et sans trop de conviction...