Chapitre 7 - Exercice 2

je comprends pas pourquoi les 500 ans ne correspondent pas aux 12000géné/an pour 2 copies...?

C'est pas des génération/an... vu que c'est un temps de coalescence qui se mesure en génération!

500 ans = 500 générations
on regarde, pour pas s'ennuyer avec les 60 copies de genes, en cmb de temps coalescent 2 copies --> pages 5 du chap 6
E(T2)=2N générations --> 12000 générations pour 2 copies

Ps: mes notes sont pas completent, est ce qu'on peut considéré avec Beerli Felsenstien?
Moi je dirais non sauf si on considère taux mutation cst et equilibre mutation-dérive.
C'ets bien ca?

Non, on ne peut pas l'utiliser si N=5000+4000+3000 car le temps de coalescence moyen (E(t)=12 000) est plus long que le nombre de générations depuis la séparation, donc on est surement pas à l'équilibre pour ces loci.

Par contre si la pop est de N=300 alors le temps de coalescence (E(t)=300) est plus bas que le nombre de générations depuis la séparation, donc probablement que c'est stable, on peut donc utiliser Beerli Felsenstein sans trop de risque.

C'est ce que j'ai noté mais je me demande pour quoi on prend les mouches comme haploïdes E(t)=300 et pas diploïdes E(t)=2N=600 ... enfin ça change pas grand chose c'est le raisonnement qui est important.